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News

We are happy to invite you to an upcoming talk by Dr. Matthieu Schapranow from the HPI Potsdam within the ScaDS colloquium.

Title: Analyze Genomes - A Federated In-Memory Database Computing Platform Enabling Real‐Time Analysis of Big Medical Data

Speaker: Dr. Matthieu Schapranow

Location: ScaDS-Offices in Leipzig, Ritterstrasse 9-13, 14:30h

Abstract:

In an increasing number of cases, medical experts discover roots of complex dis-eases, such as cancer, within the human genome. Therefore, analyses of the individual genetic code of each patient are the foundation of the precision medicine approach. However, the acquisition of the genetic profile is very time-consuming, e.g. due to the high number of required process steps, the sheer amount of data, and the use of individual data formats.

Together with experts from life sciences, such as medical experts, biologists, and geneticists, researcher of the Hasso Plattner Institute (HPI) have developed the cloud platform „Analyze Genomes“ (http://we.analyzegenomes.com/).

It builds upon latest in-memory technology to enable new perspectives for precision medicine in the clinical routine. The platform enables a completely new way of working. Medical experts and researchers are no longer slowed down by long-running data processing steps. Instead they can test and verify their hypotheses in real time. Through the integration and combination with worldwide sources of medical knowledge manual and time-consuming searches in the Internet are omitted. As a result, precise treatment decisions can be made always on the basis of the latest available, worldwide medical knowledge for the patient’s sake.

 

Short Bio and Photo

For short bio and photo, please refer to 

https://hpi.de/plattner/people/postdocs/dr-matthieu-schapranow/matthieuschapranowbioen.html 

or for a German version to

http://hpi.de/plattner/people/postdocs/dr-matthieu-schapranow/matthieuschapranowbiode.html 

 

We are happy to invite you to an upcoming presentation within the ScaDS colloquium by

Prof. Dr. Felix Freiling, University Erlangen,  on forensic computing.

Topic: Using Science to Solve (Cyber)Crime - Case Studies in Forensic Computing

Read more...Prof. Dr. Felix Freiling talks in Leipzig Jan 19th, 2017

Wir suchen an der Universität Leipzig baldmöglichst eine/n Mitarbeiter/in zur Forschung/Entwicklung im Themenbereich Big Data insbesondere zur Graphanalyse. Die Arbeiten erfolgen innerhalb des BMBF-Projekts BIGGR in Kooperation mit dem Unternehmen KNIME.com GmbH und dem Kompetenzzentrum für Big Data (www.scads.de).

Weitere Informationen finden Sie hier

Die Bewerbungsfrist ist abgeschlossen

 

ScaDS at Postersession BBZ/IDIV - December 2nd, 2016

Today ScaDS was invited to a cross-institute postersession in the Leipzig Bio City. We were presenting ScaDS, the Golden-Genome and Peak-Calling. We had some interesting discussions with groups from IDIV-Halle, Leipzig and the BBZ and are looking forward to several opportunities for followup and collaboration.

 

Big Data in Business workshop - 15./16. Juni  2017 in Leipzig

Nach der positiven Rückmeldung zum Big Data in Business Workshop 2015 (www.scads.de/bidib2015) haben wir uns entschieden den Workshop als 2-Tages Veranstaltung zu wiederholen. Der Big Data in Business Workshop ermöglicht Vertretern regionaler und international agierender Unternehmen sowie Wissenschaftlern aus der Informatik einen praxisbezogenen fachlichen Austausch. In Zeiten der Digitalen Transformation werden weite Teile der Industrie zunehmend mit der Problematik enorm großer und komplex aufgebauter Datenmengen konfrontiert, die einerseits großes wirtschaftliches Potential, anderseits viele bisher nicht umfassend adressierte praktische Hürden mit sich bringen. Der IT-Sektor erarbeitet unter dem Schlagwort Big Data derzeit Schlüsseltechnologien, mit dem sich die Verwaltung und Analyse großer Datenmengen gewinnbringend und verlässlich durchführen lassen.

Die Referenten berichten im Rahmen des Workshops über Strategien und gefundene Best Practices aus Ihren Organisationen und diskutieren mit den Teilnehmern über aktuelle Fragestellungen, Technologien und ihre bisherigen Erfahrungen. Zusätzlich informieren die Leipziger Forscher über ihre bisherigen Ergebnisse und prototypischen Lösungen. Der Workshop soll daher insbesondere bestehende Kooperationen festigen und ausbauen sowie den Kontakt zu weiteren Kooperationspartnern schaffen.

Während des Workshops werden viele Freiräume für die Interaktion der Teilnehmer zur Verfügung stehen, um über vorgestellte Lösungen und Problemstellungen ausführlich diskutieren zu können. Zusätzlich laden wir alle Teilnehmer am Abend zu einem Big Data Buffet im Bayrischen Bahnhof ein und freuen und auf spannende Diskussionen und Austausch.

Read more...Big Data in Business workshop 2017